المحتوى
علم الجينوم هو فرع من علم الوراثة يدرس التغيرات الواسعة النطاق في جينومات الكائنات الحية. علم الجينوم وحقله الفرعي للنصوص ، الذي يدرس التغيرات على نطاق الجينوم في الحمض النووي الريبي التي تم نسخها من الحمض النووي ، يدرس العديد من الجينات مرة واحدة. قد تتضمن الجينوم أيضًا قراءة ومحاذاة تسلسلات طويلة جدًا من الحمض النووي أو الحمض النووي الريبي. يتطلب تحليل وتفسير هذه البيانات المعقدة واسعة النطاق مساعدة أجهزة الكمبيوتر. العقل البشري ، كما هو رائع ، غير قادر على التعامل مع هذه المعلومات الكثيرة. المعلوماتية الحيوية هي حقل هجين يجمع بين علم الأحياء ومعرفة علم المعلومات ، وهو مجال فرعي لعلوم الكمبيوتر.
الجينومات تحتوي على الكثير من المعلومات
جينومات الكائنات الحية كبيرة جدا. يقدر الجينوم البشري بوجود ثلاثة مليارات زوج من الأزواج تحتوي على حوالي 25000 جين. للمقارنة ، يقدر أن ذبابة الفاكهة تحتوي على 165 مليار زوج قاعدة تحتوي على 13000 جين. بالإضافة إلى ذلك ، هناك حقل فرعي من علم الجينوم يدعى دراسات transcriptomics التي يتم فيها تشغيل أو إيقاف تشغيل الجينات ، من بين عشرات الآلاف في الكائن الحي ، في وقت معين ، عبر نقاط زمنية متعددة ، وظروف تجريبية متعددة في كل نقطة زمنية. بمعنى آخر ، تحتوي بيانات "omics" على كميات هائلة من المعلومات التي لا يستطيع العقل البشري إدراكها دون مساعدة الطرق الحسابية في المعلوماتية الحيوية.
البيانات البيولوجية
المعلوماتية الحيوية مهمة للبحث الوراثي لأن البيانات الوراثية لها يخدع. يخدع هو علم الأحياء. أشكال الحياة لها قواعد سلوك معينة. الأمر نفسه ينطبق على الأنسجة والخلايا والجينات والبروتينات. يتفاعلون بطرق معينة وينظمون بعضهم البعض بطرق معينة. البيانات المعقدة واسعة النطاق التي يتم إنشاؤها في علم الجينوم لن تكون منطقية بدون المعرفة الكيفية لكيفية عمل الحياة. قد يتم تحليل البيانات الناتجة عن الجينوم بالطرق نفسها التي يستخدمها المهندسون والفيزيائيون الذين يدرسون أسواق المال والألياف البصرية ، لكن تحليل البيانات بطريقة منطقية يتطلب معرفة في علم الأحياء. وهكذا ، أصبحت المعلوماتية الحيوية مجالًا هجينًا لا يقدر بثمن للمعرفة.
الطحن الآلاف من الأرقام
يمثل رقم الطحن طريقة للقول بأن الشخص يقوم بالحسابات. المعلوماتية الحيوية قادرة على تحطيم عشرات الآلاف من الأرقام في بضع دقائق ، وهذا يتوقف على مدى السرعة التي يمكن للكمبيوتر معالجة المعلومات. تستخدم أبحاث Omics أجهزة الكمبيوتر لتشغيل الخوارزميات - الحسابات الرياضية - على نطاق واسع للعثور على أنماط في مجموعات البيانات الكبيرة. تشمل الخوارزميات الشائعة وظائف مثل التجميع الهرمي (انظر المرجع 3) وتحليل المكون الرئيسي. كلاهما تقنيات للعثور على العلاقات بين العينات التي لديها العديد من العوامل فيها. يشبه هذا تحديد ما إذا كانت بعض الأعراق أكثر شيوعًا بين قسمين في دفتر الهاتف: الأسماء الأخيرة التي تبدأ بحرف A مقابل الأسماء الأخيرة التي تبدأ بحرف B.
بيولوجيا النظم
جعلت المعلوماتية الحيوية من الممكن دراسة كيف يتصرف النظام الذي يحتوي على الآلاف من الأجزاء المتحركة على مستوى جميع الأجزاء المتحركة في وقت واحد. هو مثل مشاهدة قطيع من الطيور تطير في انسجام تام أو مدرسة للأسماك تسبح في انسجام تام. سابقا ، درس علماء الوراثة فقط جين واحد في وقت واحد. على الرغم من أن هذا النهج لا يزال يتمتع بقدر لا يصدق من الجدارة وسيواصل القيام بذلك ، فقد سمحت المعلوماتية الحيوية بإجراء اكتشافات جديدة. بيولوجيا الأنظمة هي طريقة لدراسة نظام بيولوجي عن طريق قياس أجزاء متحركة متعددة ، مثل دراسة السرعة الجماعية لمختلف جيوب الطيور التي تطير كقطيع كبير يحيد.