المحتوى
Lyse هي الكلمة التي تأتي من اليونانية وتعني مجرد "تقسيم" أو "للانفجار". وبصورة مناسبة ، تتعلق المصطلحات بما يحدث للخلايا في محلل تحلل ، وهو حل يكسرها مفتوحًا لاستخراج محتوياتها. يستخدم العلماء مخازن تحلل عند استخراج الحمض النووي أو البروتينات من الخلايا لتحليلها ، وخاصة في حالة البكتيريا. يختلف نوع المخزن المؤقت لتحلل الخلايا اعتمادًا على نوع التجربة ، على الرغم من أن هناك بعض الخيارات الشائعة.
TL ؛ DR (طويل جدًا ؛ لم يقرأ)
تساعد المخازن المؤقتة للتحلل في كسر الخلايا المفتوحة ، بحيث يمكن الوصول إلى محتوياتها أو إزالتها. بعض الأمثلة تشمل الأملاح والمنظفات وعوامل مخلبية ومثبطات ، وبعض المواد الكيميائية القلوية.
العازلة والملح
تستقر المخازن المؤقتة في درجة الحموضة بينما تنقسم الخلايا. يعتبر Tris-HCL أحد أكثر المواد الكيميائية شيوعًا للتخزين المؤقت عند pH 8. HEPES هو مادة كيميائية عازلة شائعة أخرى في هذه التجارب. قد يرفع ملح كلوريد الصوديوم أيضًا من القوة الأيونية ، أي التركيز الكلي للمواد المذابة خارج الخلايا. هذه النقطة الأخيرة لها بعض الأهمية لأن الماء يمكن أن ينتشر عبر أغشية الخلايا من المناطق ذات التركيز المنخفض للذوبان إلى المناطق ذات التركيز العالي للذوبان.
إذابة المنظفات
تقوم المنظفات بحل أغشية الخلايا حتى تتمكن محتويات الخلية من الهرب. الهيكل الجزيئي ذو البنية الأمفيكية (مثل الجزيئات ذات النهاية التي تتفاعل بسهولة مع جزيئات الماء في حين أن الطرف الآخر الكارهة للماء أو "الخوف من الماء" لا). ويمكنهم إذابة الدهون عن طريق تكوين micelles ، وتجمعات صغيرة حيث تشير ذيول الكارهة للماء لجزيئات المنظفات إلى الداخل نحو جزيئات الدهون. تشمل المنظفات الشائعة كبريتات دوديسيل الصوديوم أو SDS و NP-40 و tritonX.
مخلب وكلاء ومثبطات
تشمل عازلة التحلل عادةً عوامل مخلبية مثل حمض الإيثيلين دي أمينيترايتيك (EDTA) أو حمض الإيثيلين غليكول رباعي الأسيتيك (EGTA). ترتبط هذه المواد الكيميائية بأيونات المعادن بشحنتين موجبتين (مثل المغنيسيوم والكالسيوم) ، مما يجعلها غير متاحة لتفاعلات أخرى. تحتاج العديد من الدنا (البروتينات التي تمضغ الدنا) والبروتياز (البروتينات التي تشطر البروتينات الأخرى) إلى أيونات المغنيسيوم لتعمل ، لذلك من خلال حرمانهم من هذا المكون الرئيسي ، يساعد كل من EDTA و EGTA على خفض مستوى نشاط البروتياز أو نشاط الدنا. إلا أنها لا تستبعد ذلك تمامًا ، ولا تعتمد بعض البروتياز على العوامل المساعدة للمغنيسيوم ، لذلك تتضمن المخازن المؤقتة للتحلل أحيانًا أيضًا مواد كيميائية تسمى مثبطات الأنزيم البروتيني ، والتي ترتبط بالبروتياز ، وتمنعها من العمل بشكل صحيح.
القلوية تحلل
يشمل تحلل القلوية ، وهو تقنية شائعة جدًا لتنقية البلازميدات من البكتيريا ، ثلاثة حلول. أول واحد يحتوي على الجلوكوز ، المخزن المؤقت تريس - HCL ، EDTA ، و RNAses. يخلق الجلوكوز تركيزًا عاليًا للذوبان خارج البكتيريا حتى يصبح مستنقعًا قليلًا ، مما يجعله أسهل في التكاثر. تعمل كل من EDTA و tris-HCL على النحو الموصوف بالفعل ، بينما يقوم RNAse بمضغ أي RNA داخل الخلية لإخراجها من الطريق. الحل الثاني في الواقع يفسد الخلايا. يحتوي هذا واحد على منظف SDS و NaOH ، الذي يرفع الرقم الهيدروجيني إلى 12 أو أعلى ، مما يؤدي إلى تغيير طبيعة البروتينات داخل الخلية ويسبب انفصال الحمض النووي إلى فروع مفردة. يحتوي المحلول الثالث على أسيتات البوتاسيوم لاستعادة الرقم الهيدروجيني إلى مستوى أكثر حيادية حتى يمكن للحمض النووي DNA البلازميدي أن يعود مرة أخرى. في هذه الأثناء ، تتجمع البروتينات المهتمة بالترسبات وترسب ، في حين تتحد أيونات كبريتات الدوديسيل مع أيونات البوتاسيوم لتشكيل مركب غير قابل للذوبان ، يترسب أيضًا من المحلول.